Aby przemieścic obiekt w hierarchii należy kliknąć go prawym przyciskiem myszy w drzewku, a następnie wybrać opcję Przemieść w hierarchii. W wyświetlonym oknie można wybrać nowy obiekt nadrzędny dla przenoszonego obiektu.
Aby połączyć obiekt z innym obiektem należy z menu kontekstowego w drzewku wybrać Połącz z innym obiektem. W wyświetlonym oknie można wybrać obiekt do połączenia.
Opcje te są szczególnie przydatne w przypadku błędów w załadowanych danych związanych z hierarchią.
Na przykład: w drzewie znajdują się dwa czasopisma o tej samej nazwie, oba zawierające pewną liczbę atykułów.
W takim przypadku należy je ze sobą połączyć korzystając z opcji Połącz z innym obiektem.
Analogicznie, czynność należy powtórzyć w przypadku obecności w połączonych obiektach podobiektów ze zduplikowanymi nazwami.